Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
4930407I10RikD3Z5T8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
4930407I10RikD3Z5T8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
4930407I10RikD3Z5T8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
4930407I10RikD3Z5T8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
4930407I10RikD3Z5T8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
4930407I10RikD3Z5T8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
4930407I10RikD3Z5T8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
4930407I10RikD3Z5T8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
4930407I10RikD3Z5T8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
4930407I10RikD3Z5T8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
4930407I10RikD3Z5T8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
4930407I10RikD3Z5T8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
4930407I10RikD3Z5T8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
4930407I10RikD3Z5T8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
4930407I10RikD3Z5T8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
4930407I10RikD3Z5T8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
4930407I10RikD3Z5T8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
4930407I10RikD3Z5T8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
4930407I10RikD3Z5T8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
4930407I10RikD3Z5T8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
4930407I10RikD3Z5T8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
4930407I10RikD3Z5T8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
4930407I10RikD3Z5T8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
4930407I10RikD3Z5T8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
4930407I10RikD3Z5T8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
4930407I10RikD3Z5T8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
4930407I10RikD3Z5T8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
4930407I10RikD3Z5T8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms