Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ldlrad1D3YYZ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ldlrad1D3YYZ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ldlrad1D3YYZ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ldlrad1D3YYZ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ldlrad1D3YYZ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ldlrad1D3YYZ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ldlrad1D3YYZ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ldlrad1D3YYZ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ldlrad1D3YYZ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ldlrad1D3YYZ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ldlrad1D3YYZ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ldlrad1D3YYZ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ldlrad1D3YYZ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ldlrad1D3YYZ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ldlrad1D3YYZ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ldlrad1D3YYZ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ldlrad1D3YYZ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ldlrad1D3YYZ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ldlrad1D3YYZ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ldlrad1D3YYZ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ldlrad1D3YYZ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms