Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Samd1D3YXK1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samd1D3YXK1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Samd1D3YXK1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samd1D3YXK1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Samd1D3YXK1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms