Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a6B1AVK5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a6B1AVK5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Col4a6B1AVK5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col4a6B1AVK5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a6B1AVK5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a6B1AVK5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Col4a6B1AVK5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a6B1AVK5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a6B1AVK5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a6B1AVK5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a6B1AVK5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a6B1AVK5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a6B1AVK5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a6B1AVK5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a6B1AVK5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms