Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
1700042G07RikB1AUF7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
1700042G07RikB1AUF7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms