Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trabd2bB1ATG9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trabd2bB1ATG9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trabd2bB1ATG9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trabd2bB1ATG9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trabd2bB1ATG9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trabd2bB1ATG9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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