Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Plcb2A3KGF7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plcb2A3KGF7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Plcb2A3KGF7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plcb2A3KGF7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Plcb2A3KGF7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Plcb2A3KGF7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms