Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samt1A2BED8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samt1A2BED8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samt1A2BED8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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