Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itga8A2ARA8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga8A2ARA8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga8A2ARA8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Itga8A2ARA8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga8A2ARA8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms