Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SktA2AQ25 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SktA2AQ25 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SktA2AQ25 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SktA2AQ25 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SktA2AQ25 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SktA2AQ25 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SktA2AQ25 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SktA2AQ25 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SktA2AQ25 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SktA2AQ25 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SktA2AQ25 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SktA2AQ25 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SktA2AQ25 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SktA2AQ25 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms