Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtcflA2APF3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtcflA2APF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtcflA2APF3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtcflA2APF3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtcflA2APF3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms