Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syndig1A2ANU3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syndig1A2ANU3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syndig1A2ANU3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syndig1A2ANU3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syndig1A2ANU3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms