Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd7A2AJK6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd7A2AJK6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chd7A2AJK6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd7A2AJK6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd7A2AJK6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd7A2AJK6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd7A2AJK6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd7A2AJK6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd7A2AJK6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd7A2AJK6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd7A2AJK6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd7A2AJK6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd7A2AJK6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd7A2AJK6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd7A2AJK6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd7A2AJK6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms