Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34dA2AGU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34dA2AGU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn34dA2AGU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn34dA2AGU5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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