Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col9a3A2ACT7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col9a3A2ACT7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col9a3A2ACT7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col9a3A2ACT7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col9a3A2ACT7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col9a3A2ACT7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a3A2ACT7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col9a3A2ACT7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col9a3A2ACT7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col9a3A2ACT7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col9a3A2ACT7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col9a3A2ACT7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col9a3A2ACT7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a3A2ACT7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col9a3A2ACT7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col9a3A2ACT7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col9a3A2ACT7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a3A2ACT7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms