Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700023F06RikA2AB62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700023F06RikA2AB62 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700023F06RikA2AB62 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700023F06RikA2AB62 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700023F06RikA2AB62 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
1700023F06RikA2AB62 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
1700023F06RikA2AB62 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700023F06RikA2AB62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700023F06RikA2AB62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700023F06RikA2AB62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700023F06RikA2AB62 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700023F06RikA2AB62 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700023F06RikA2AB62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700023F06RikA2AB62 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms