Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef6A2A8M8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pramef6A2A8M8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pramef6A2A8M8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef6A2A8M8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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