Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Krtap1-3A2A588 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Krtap1-3A2A588 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Krtap1-3A2A588 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Krtap1-3A2A588 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Krtap1-3A2A588 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms