Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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