Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRP6

Gm28576, Predicted gene 28576, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28576A0A087WRP6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28576A0A087WRP6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28576A0A087WRP6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28576A0A087WRP6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28576A0A087WRP6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms