Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbc2A0A075B5J4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbc2A0A075B5J4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbc2A0A075B5J4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trbc2A0A075B5J4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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