Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col5a3Q9JLI2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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