Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx6Q9ER75 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx6Q9ER75 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms