Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tor1aQ9ER39 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms