Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad1Q9D5T0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad1Q9D5T0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad1Q9D5T0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad1Q9D5T0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad1Q9D5T0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.5 ms