Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan11Q9D1D1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms