Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG7

Rapgef2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef2Q8CHG7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef2Q8CHG7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms