Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc30Q8BVF4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms