Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms