Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2surpQ6NV83 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms