Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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