Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Knl1Q66JQ7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.6 ms