Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms