Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrmoQ562D6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrmoQ562D6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms