Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5cP41230 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm5cP41230 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms