Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col5a3Q9JLI2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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