Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hmgn5Q9JL35 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hmgn5Q9JL35 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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