Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2c55Q9D816 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms