Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG7

Rapgef2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef2Q8CHG7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef2Q8CHG7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef2Q8CHG7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef2Q8CHG7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms