Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot1Q6ZQ08 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms