Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2surpQ6NV83 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2surpQ6NV83 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms