Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
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