Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif3aP28741 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif3aP28741 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms