Protein–RNA interactions for Protein: P09793

Ctla4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla4P09793 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctla4P09793 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla4P09793 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms