Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms