Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2f6O54917 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms