Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna3O08545 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms