Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.01■■□□□ 1.6
Rfx7F8VPJ6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfx7F8VPJ6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms