Protein–RNA interactions for Protein: E9PZZ1

Prdm13, PR domain zinc finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm13E9PZZ1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm13E9PZZ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm13E9PZZ1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms