Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms